在MPLAB? X IDE中可以對一個包含同一套源文件的單個項目設置多種不同的配置，從而方便地實現將一個項目的同一套源文件按不同方式進行編譯和調試/編程。每一種“配置”都可以有自己的目標器件型號、硬件調試/編程器、編譯器、以及編譯器選項。設置多種不同的配置通過項目屬性對話框進行，在項目屬性對話框中點擊“Manage Configurations...",在彈出窗口中點擊“New”創建新的配置，再回到項目屬性對話框種對新創建的配置進行選項設置。設置好多種配置后，可以在MPLAB X IDE工具欄中的“項目配置下拉框”進行配置選擇，也可以在“Manage Configurations..."中選擇一種配置并“Set Active”作為當前有效配置。